Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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ECM1Q16610 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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ECM1Q16610 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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ECM1Q16610 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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ECM1Q16610 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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ECM1Q16610 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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ECM1Q16610 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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ECM1Q16610 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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ECM1Q16610 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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