Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CCDC85BQ15834 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CCDC85BQ15834 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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