Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SS18Q15532 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SS18Q15532 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SS18Q15532 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SS18Q15532 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SS18Q15532 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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