Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
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DDX39BQ13838 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
DDX39BQ13838 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
DDX39BQ13838 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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