Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CUL4AQ13619 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms