Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AP005597.2-201ENST00000526238 341 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC099667.1-201ENST00000624222 469 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL589993.1-201ENST00000407450 2524 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LINC00861-201ENST00000500989 5330 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC096922.1-201ENST00000461635 651 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC066616.1-201ENST00000486795 413 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC097478.1-207ENST00000612706 2422 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 FAR2P1-201ENST00000325390 3679 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 BMPR1B-201ENST00000264568 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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