Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
BPTFQ12830 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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