Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
PDE4DQ08499 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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