Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CTLA4P16410 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms