Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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