Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
TRAPPC9Q96Q05 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms