Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RTL8BQ17RB0 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.9 ms