Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ECM1Q16610 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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