Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TAF1AQ15573 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms