Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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CHD4Q14839 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CHD4Q14839 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CHD4Q14839 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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CHD4Q14839 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHD4Q14839 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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