Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMPOP42166 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TMPOP42166 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TMPOP42166 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TMPOP42166 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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