Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TRHP20396 BUB1-202ENST00000409311 3287 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TRHP20396 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TRHP20396 OPALIN-201ENST00000371172 3557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TRHP20396 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TRHP20396 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
TRHP20396 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
TRHP20396 OCLN-205ENST00000538151 5391 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
TRHP20396 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 SLC4A10-201ENST00000272716 3414 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AC012360.3-201ENST00000610036 3449 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
TRHP20396 AGTPBP1-202ENST00000357081 4393 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
TRHP20396 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
TRHP20396 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TRHP20396 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TRHP20396 UTY-202ENST00000331397 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
TRHP20396 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 FUT10-206ENST00000518672 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC091390.2-201ENST00000432573 374 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 ENTPD5-201ENST00000334696 5842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 ZNF107-204ENST00000423627 5773 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
TRHP20396 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 AC244502.1-201ENST00000514473 1951 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 ILDR2-201ENST00000271417 13140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 OR2T33-202ENST00000641220 4118 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
TRHP20396 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms