Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
PTPRCP08575 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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PTPRCP08575 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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PTPRCP08575 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRCP08575 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRCP08575 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRCP08575 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRCP08575 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRCP08575 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRCP08575 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRCP08575 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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