Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SH3BP1Q9Y3L3 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SH3BP1Q9Y3L3 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.1 ms