Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ZNF548Q8NEK5 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.5 ms