Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IMPG1Q17R60 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
IMPG1Q17R60 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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