Protein–RNA interactions for Protein: Q16612

NREP, Neuronal regeneration-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NREPQ16612 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
NREPQ16612 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
NREPQ16612 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NREPQ16612 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 MIR6737-201ENST00000617385 70 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NREPQ16612 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NREPQ16612 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms