Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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SGCAQ16586 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
SGCAQ16586 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
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SGCAQ16586 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCAQ16586 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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