Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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GRIK4Q16099 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
GRIK4Q16099 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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