Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SS18Q15532 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms