Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYCP1Q15431 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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SYCP1Q15431 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SYCP1Q15431 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SYCP1Q15431 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SYCP1Q15431 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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