Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 HID1-AS1-201ENST00000577295 815 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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RYR3Q15413 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
RYR3Q15413 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
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