Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
RFTN1Q14699 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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