Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CNGB1Q14028 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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