Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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SF3B2Q13435 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
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SF3B2Q13435 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
SF3B2Q13435 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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