Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SP140Q13342 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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SP140Q13342 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SP140Q13342 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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