Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CLN3Q13286 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms