Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 ZNF257-203ENST00000594947 3874 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 POT1-AS1-203ENST00000435452 2147 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
MKRN3Q13064 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 IGKV3-7-201ENST00000390247 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DCX-205ENST00000488120 2476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC087430.1-201ENST00000451707 3699 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 LNPEP-202ENST00000395770 3888 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 NEUROD4-201ENST00000242994 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 UGT2B4-201ENST00000305107 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL034417.4-202ENST00000642135 2236 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ZNF585B-204ENST00000531805 2971 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
MKRN3Q13064 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
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