Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
GRIK2Q13002 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
GRIK2Q13002 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms