Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
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BPTFQ12830 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
BPTFQ12830 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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