Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
RBBP4Q09028 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms