Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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UBXN4Q92575 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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UBXN4Q92575 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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UBXN4Q92575 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN4Q92575 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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