Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
FAM187BQ17R55 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FAM187BQ17R55 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms