Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SGCBQ16585 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
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