Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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VAMP3Q15836 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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VAMP3Q15836 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAMP3Q15836 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
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