Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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DDX39BQ13838 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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DDX39BQ13838 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDX39BQ13838 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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