Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
ALCAMQ13740 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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