Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL4BQ13620 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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