Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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NPRL3Q12980 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
NPRL3Q12980 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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