Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHRNEQ04844 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms