Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NEDD1Q8NHV4 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms