Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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CCDC142Q17RM4 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CCDC142Q17RM4 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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