Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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ECM1Q16610 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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ECM1Q16610 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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ECM1Q16610 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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ECM1Q16610 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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ECM1Q16610 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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ECM1Q16610 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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ECM1Q16610 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
ECM1Q16610 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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