Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HMGN3Q15651 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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