Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TAF1AQ15573 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms